Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm10509O88255 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm10509O88255 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm10509O88255 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm10509O88255 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm10509O88255 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Gm10509O88255 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Gm10509O88255 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm10509O88255 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm10509O88255 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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