Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly86O88188 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly86O88188 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ly86O88188 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ly86O88188 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ly86O88188 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly86O88188 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly86O88188 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly86O88188 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ly86O88188 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly86O88188 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ly86O88188 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly86O88188 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ly86O88188 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms