Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2f6O54917 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f6O54917 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2f6O54917 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f6O54917 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f6O54917 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f6O54917 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f6O54917 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2f6O54917 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
E2f6O54917 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E2f6O54917 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms