Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limk2O54785 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limk2O54785 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Limk2O54785 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Limk2O54785 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Limk2O54785 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Limk2O54785 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Limk2O54785 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limk2O54785 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Limk2O54785 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Limk2O54785 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limk2O54785 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Limk2O54785 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms