Protein–RNA interactions for Protein: O35945

Aldh1a7, Aldehyde dehydrogenase, cytosolic 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a7O35945 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a7O35945 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a7O35945 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a7O35945 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a7O35945 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a7O35945 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a7O35945 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a7O35945 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a7O35945 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Aldh1a7O35945 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a7O35945 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a7O35945 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a7O35945 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Aldh1a7O35945 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh1a7O35945 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh1a7O35945 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh1a7O35945 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Aldh1a7O35945 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Aldh1a7O35945 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Aldh1a7O35945 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Aldh1a7O35945 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Aldh1a7O35945 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh1a7O35945 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh1a7O35945 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh1a7O35945 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Aldh1a7O35945 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh1a7O35945 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh1a7O35945 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh1a7O35945 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Aldh1a7O35945 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms