Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm9602J3QPD5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm9602J3QPD5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm9602J3QPD5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm9602J3QPD5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm9602J3QPD5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm9602J3QPD5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm9602J3QPD5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm9602J3QPD5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm9602J3QPD5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm9602J3QPD5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gm9602J3QPD5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gm9602J3QPD5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms