Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm2035J3QP87 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm2035J3QP87 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm2035J3QP87 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm2035J3QP87 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm2035J3QP87 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm2035J3QP87 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm2035J3QP87 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm2035J3QP87 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm2035J3QP87 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gm2035J3QP87 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm2035J3QP87 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm2035J3QP87 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm2035J3QP87 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gm2035J3QP87 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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