Protein–RNA interactions for Protein: E9PVJ0

Gm2956, Predicted gene 2956, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2956E9PVJ0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm2956E9PVJ0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gm2956E9PVJ0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gm2956E9PVJ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms