Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0W7

Gm4871, MCG126741, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4871D3Z0W7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm4871D3Z0W7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm4871D3Z0W7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm4871D3Z0W7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm4871D3Z0W7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm4871D3Z0W7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm4871D3Z0W7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm4871D3Z0W7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm4871D3Z0W7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gm4871D3Z0W7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm4871D3Z0W7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm4871D3Z0W7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm4871D3Z0W7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm4871D3Z0W7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm4871D3Z0W7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm4871D3Z0W7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm4871D3Z0W7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm4871D3Z0W7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm4871D3Z0W7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm4871D3Z0W7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm4871D3Z0W7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm4871D3Z0W7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm4871D3Z0W7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm4871D3Z0W7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm4871D3Z0W7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm4871D3Z0W7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm4871D3Z0W7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm4871D3Z0W7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms