Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a6B1AVK5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a6B1AVK5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col4a6B1AVK5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms