Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al1jA2BFR3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al1jA2BFR3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al1jA2BFR3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2al1jA2BFR3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2al1jA2BFR3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
H2al1jA2BFR3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
H2al1jA2BFR3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
H2al1jA2BFR3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H2al1jA2BFR3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H2al1jA2BFR3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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