Protein–RNA interactions for Protein: A2A870

Fbf1, Fas-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbf1A2A870 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Fbf1A2A870 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Fbf1A2A870 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Fbf1A2A870 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbf1A2A870 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbf1A2A870 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fbf1A2A870 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms