Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrit3W8DXL4 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms