Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Homer1Q9Z2Y3 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Homer1Q9Z2Y3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms