Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I4

Robo3, Roundabout homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo3Q9Z2I4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Robo3Q9Z2I4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms