Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1W9

Stk39, STE20/SPS1-related proline-alanine-rich protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk39Q9Z1W9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stk39Q9Z1W9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms