Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Cldn13Q9Z0S4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Cldn13Q9Z0S4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Cldn13Q9Z0S4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Cldn13Q9Z0S4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Cldn13Q9Z0S4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Cldn13Q9Z0S4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cldn13Q9Z0S4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cldn13Q9Z0S4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn13Q9Z0S4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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