Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnip1Q9WUU8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms