Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nek3Q9R0A5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms