Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Usp21Q9QZL6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp21Q9QZL6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms