Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdc42ep4Q9JM96 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms