Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tnfrsf19Q9JLL3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms