Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Slc28a3Q9ERH8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Slc28a3Q9ERH8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms