Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hmgn3Q9DCB1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms