Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Obox3-ps1-201ENSMUST00000176885 995 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 2610020F03Rik-201ENSMUST00000180401 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm18422-201ENSMUST00000203663 1032 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm8703-201ENSMUST00000203793 730 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm26203-201ENSMUST00000082911 114 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Mro-206ENSMUST00000179472 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Riok3Q9DBU3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Trdv4-201ENSMUST00000103679 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm6620-201ENSMUST00000120113 715 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Nme7-201ENSMUST00000086028 834 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Olfr121-202ENSMUST00000174675 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Riok3Q9DBU3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms