Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pop5Q9DB28 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Pop5Q9DB28 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms