Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prpf4Q9DAW6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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