Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rsph3bQ9DA80 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rsph3bQ9DA80 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms