Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Capns2Q9D7J7 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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