Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D7E4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Q9D7E4 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms