Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cldn23Q9D7D7 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn23Q9D7D7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn23Q9D7D7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn23Q9D7D7 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn23Q9D7D7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Cldn23Q9D7D7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cldn23Q9D7D7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms