Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc6Q9D4E6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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