Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cfap53Q9D439 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms