Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Mrpl53Q9D1H8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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