Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Syf2Q9D198 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Syf2Q9D198 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms