Protein–RNA interactions for Protein: Q9D110

Mthfs, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfsQ9D110 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MthfsQ9D110 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms