Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B0

Srsf9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf9Q9D0B0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Srsf9Q9D0B0 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Srsf9Q9D0B0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms