Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hdhd3Q9CYW4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms