Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Tmed5Q9CXE7 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Tmed5Q9CXE7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms