Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Snx10Q9CWT3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx10Q9CWT3 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms