Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rprd1bQ9CSU0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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