Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Mrpl35Q9CQL6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms