Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndufb9Q9CQJ8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms