Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl11Q9CQF0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms