Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
RTRAFQ9CQE8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms