Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pkp2Q9CQ73 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms