Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg3Q9CPX6 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms