Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Smim3Q99PE5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Smim3Q99PE5 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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