Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl3Q99N95 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms