Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hps4Q99KG7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms